LA COMPLEJIDAD BIOQUIMICA DE LOS SERES VIVOS
La mayor complejidad se da en los seres humanos, en ellos existen: 1) sistemas ( nervioso, inmunitario, circulatorio, oseo, endocrino, metabolico unitario, etc.). 2) aparatos (digestivo, respiratorio, genito-urinario, etc.. 3) organos ( estomago, páncreas, intestino, higado, pulmones, riñones, corazon, etc. 4) tejidos ( epitelial, glandular, muscular, etc. 5) celulas ( con metabolismos especificos en cada uno y en numero muy elevado). 6) metabolismos en numero de 20 para su estudio con reacciones quimicas en numero elevadisimo ( varios cientos de miles) ; todo ello esta relacionado funcionalmente de hay la dificultad de un conocimiento global.
Me voy a referir aquí como bioquimico, solo en algunas de las relaciones en el apartado 6 en lo que se refiere al metabolismo de entrada de la glucosa en la celula ( M-1 ) ( ver en este blogg); es importante esta primera etapa metabolica porque lleva aparejada la entrada de aminoácidos e intercambio de iones ( sodio, potasio, calcio, preferentemente) intra y extra celularmente y a continuación las 10 reaciones siguientes hasta la formación de a. piruvico (metabolismo anaerobio de la glucosa) (ver en este blogg el M-1) son fundamentales para las regulaciones de los otros 19 metabolismos celulares, a continuación la formación de RNA (M-6) y la sintesis de proteinas (M-7), junto al (M-13) ( ciclo oxidativo de la glucosa o de Krebs ),son igualmente esenciales para la inter-regulacion de los otros 17 metabolismos intracelulares que pueden darse en cada celula. Ver en este blogg específicamente cada uno de los metabolismos (M) , asi como lo que se conoce como reguloma para saber de una manera especifica y extensamente el funcionamiento global de las celulas.
lunes, 19 de abril de 2010
miércoles, 7 de abril de 2010
MAS SOBRE EL REGULOMA
El reguloma como conjunto de reacciones bioquímicas inter e intra celulares es complejo por su extensión y al tiempo por su especificidad en cada paso, si bien el resultado final depende de la union de todos y cada uno de sus elementos. Todo el reguloma tiene unas substancias primarias como son : 1) los hidratos de carbono ( principalmente la glucosa). 2) los aminoácidos ( principalmente la glicina,el a. aspartico y el a. glutámico. 3)los iones ( principalmente, fosforo, sodio, potasio y calcio). 4) el oxigeno ( principalmente para la formación de ATP). 5) substancias esenciales ( pricipalmente vitaminas, hormonas y algunos amioacidos). 6) el agua como disolvente; a partir de ellas y bajo la dirección del reguloma se van a crear las reacciones bioquímicas que van a dar lugar a las lineas de formación de a. grasos; fosfolipidos; colesterol y lipidos complejos por un lado; por otro de pentosas; bases; nucleotidos y ARN-ADN, y por una tercera linea a proteinas ( receptores y bombas ionicas de membranas ,productos mensajeros y señalizadores y transcriptores como substancias finales).
Las regulaciones se hacen a distintos niveles, asi en la entrada de glucosa al interior celular algunos aminoácidos el sodio el potasio y algunas hormonas (preferentemente insulina),junto al ATP y la enzima hexoquinasa forman un sistema de regulación imprescindible para que se efectue la entrada de la glucosa a traves de la membrana externa de la celula; en el regulación inter-metabolismos la formación de nucleotidos tipo ATP,GTP,CTP,UTP Y TTP , son clave actuando como mensajeros regulando reacciones metabolicas intracelulares a traves de los sistemas enzimaticos ( ver en este blogg cada reaccion de un modo especifico )que van a actuar como transcriptores de la s reacciones ADN-ARN; igualmente las reaciones extracelulares atraves de los receptores y transportadores de membranas celulares. Los nucleotidos estan regulados por los metabolismos de las pentosas , aminoácidos y sistemas mitocondriales ( ver metabolismos en este blogg).
El reguloma como conjunto de reacciones bioquímicas inter e intra celulares es complejo por su extensión y al tiempo por su especificidad en cada paso, si bien el resultado final depende de la union de todos y cada uno de sus elementos. Todo el reguloma tiene unas substancias primarias como son : 1) los hidratos de carbono ( principalmente la glucosa). 2) los aminoácidos ( principalmente la glicina,el a. aspartico y el a. glutámico. 3)los iones ( principalmente, fosforo, sodio, potasio y calcio). 4) el oxigeno ( principalmente para la formación de ATP). 5) substancias esenciales ( pricipalmente vitaminas, hormonas y algunos amioacidos). 6) el agua como disolvente; a partir de ellas y bajo la dirección del reguloma se van a crear las reacciones bioquímicas que van a dar lugar a las lineas de formación de a. grasos; fosfolipidos; colesterol y lipidos complejos por un lado; por otro de pentosas; bases; nucleotidos y ARN-ADN, y por una tercera linea a proteinas ( receptores y bombas ionicas de membranas ,productos mensajeros y señalizadores y transcriptores como substancias finales).
Las regulaciones se hacen a distintos niveles, asi en la entrada de glucosa al interior celular algunos aminoácidos el sodio el potasio y algunas hormonas (preferentemente insulina),junto al ATP y la enzima hexoquinasa forman un sistema de regulación imprescindible para que se efectue la entrada de la glucosa a traves de la membrana externa de la celula; en el regulación inter-metabolismos la formación de nucleotidos tipo ATP,GTP,CTP,UTP Y TTP , son clave actuando como mensajeros regulando reacciones metabolicas intracelulares a traves de los sistemas enzimaticos ( ver en este blogg cada reaccion de un modo especifico )que van a actuar como transcriptores de la s reacciones ADN-ARN; igualmente las reaciones extracelulares atraves de los receptores y transportadores de membranas celulares. Los nucleotidos estan regulados por los metabolismos de las pentosas , aminoácidos y sistemas mitocondriales ( ver metabolismos en este blogg).
lunes, 9 de marzo de 2009
AVANCES EN BIOQUIMICA
Se esta creando una nueva nomenclatura en genomica, los genes van a ser clasificados ( agrupados ) no por su situación en el cromosoma, sino por la proteina que producen y su actuación en la reacion bioquímica especifica dentro del metabolismo general celular.
Estamos conociendo de una manera mas exacta los mecanismos bioquimicos de la transcripcion y la traducion de los genes (iniciadores y represores en los complejos llamados operon y ribosoma) . Las bases purificas adenina y guanina tienen nueve enlaces ( covalentes), el enlace 6 de la adenina tiene un -NH2 y el de la guanina un =O ; las bases pirimidinicas tienen seis enlaces ( covalentes), el uracilo tiene en el enlace 4 un =O, la timina en el enlace 4 un =O y en el 5 un -CH2 , y en la citosina el enlace 4 un -NH2 . El enlace 1 de las pirimidinas y el 9 de de las purinas se unen al 1 de la ribosa (pentosa) o desoxiribosa ( falta de OH en el enlace 2). En la ribosa y desoxiribosa el enlace 5 se une al fosfato y el 3 al otro fosfato y el enlace 1 se une a las bases. En la doble helice del DNA nos encontramos ademas con las uniones (ionicas) del enlace 4 de la timina al - NH2 del 6 de la adenina, y el 3 al 1 de la adenina, asi como el –NH2 del enlace 4 de la citosina al 6 de la guanina y el 2 de la citosina al - NH2 del 2 de la guanina ( G-C o GU y A-T); el uracilo tiene en el enlace 4 C=O y la citosina C –NH2; todos estos enlaces son conocidos como enlaces de Wattson y Crack ( quedan en las bases pirimidinicas tres enlaces libres y en las puricas seis ) ; pero existe la posibilidad de otros enlaces llamados de Hoogsteen, como son el 9 de la adenina con el 3 de la timina , el 6 -NH2 con el 4 de la timina , el 4 de la guanina con el 3 de la citosina y el 6 – NH2 de la guanina con 4 –NH2 de la citosina; estos enlaces tienen una gran importancia porque parece ser que el metabolismo de bases forma compuestos tipo enzima-base (EB) a traves de grupos amida que reconocen la doble helice de ADN , por medio de los enlaces Hoogsteen y actuan de iniciadores en el complejo de la transcripcion, abriendo la doble hebra de ADN dando lugar a la formación del ARN , al tiempo que hacen de inhibidores en la formación de proteinas ( al modo de nucleosidos).
La ribosa sustituye a la glucosa en los DNA , porque en el metabolismo de formación de bases interviene la pentosa y no la hexosa ,encontrandonos en el camino de relacionar todos los metabolismos en el conjunto que supone la celula y porque y donde una metilacion, una acetilacion, una hidroxilacion o una fosforilizacion, pueden hacer que los productos metabolicos formen o desagan los enlaces precisos para el funcionamiento de los procesos bioquimicos celulares.
Se esta creando una nueva nomenclatura en genomica, los genes van a ser clasificados ( agrupados ) no por su situación en el cromosoma, sino por la proteina que producen y su actuación en la reacion bioquímica especifica dentro del metabolismo general celular.
Estamos conociendo de una manera mas exacta los mecanismos bioquimicos de la transcripcion y la traducion de los genes (iniciadores y represores en los complejos llamados operon y ribosoma) . Las bases purificas adenina y guanina tienen nueve enlaces ( covalentes), el enlace 6 de la adenina tiene un -NH2 y el de la guanina un =O ; las bases pirimidinicas tienen seis enlaces ( covalentes), el uracilo tiene en el enlace 4 un =O, la timina en el enlace 4 un =O y en el 5 un -CH2 , y en la citosina el enlace 4 un -NH2 . El enlace 1 de las pirimidinas y el 9 de de las purinas se unen al 1 de la ribosa (pentosa) o desoxiribosa ( falta de OH en el enlace 2). En la ribosa y desoxiribosa el enlace 5 se une al fosfato y el 3 al otro fosfato y el enlace 1 se une a las bases. En la doble helice del DNA nos encontramos ademas con las uniones (ionicas) del enlace 4 de la timina al - NH2 del 6 de la adenina, y el 3 al 1 de la adenina, asi como el –NH2 del enlace 4 de la citosina al 6 de la guanina y el 2 de la citosina al - NH2 del 2 de la guanina ( G-C o GU y A-T); el uracilo tiene en el enlace 4 C=O y la citosina C –NH2; todos estos enlaces son conocidos como enlaces de Wattson y Crack ( quedan en las bases pirimidinicas tres enlaces libres y en las puricas seis ) ; pero existe la posibilidad de otros enlaces llamados de Hoogsteen, como son el 9 de la adenina con el 3 de la timina , el 6 -NH2 con el 4 de la timina , el 4 de la guanina con el 3 de la citosina y el 6 – NH2 de la guanina con 4 –NH2 de la citosina; estos enlaces tienen una gran importancia porque parece ser que el metabolismo de bases forma compuestos tipo enzima-base (EB) a traves de grupos amida que reconocen la doble helice de ADN , por medio de los enlaces Hoogsteen y actuan de iniciadores en el complejo de la transcripcion, abriendo la doble hebra de ADN dando lugar a la formación del ARN , al tiempo que hacen de inhibidores en la formación de proteinas ( al modo de nucleosidos).
La ribosa sustituye a la glucosa en los DNA , porque en el metabolismo de formación de bases interviene la pentosa y no la hexosa ,encontrandonos en el camino de relacionar todos los metabolismos en el conjunto que supone la celula y porque y donde una metilacion, una acetilacion, una hidroxilacion o una fosforilizacion, pueden hacer que los productos metabolicos formen o desagan los enlaces precisos para el funcionamiento de los procesos bioquimicos celulares.
jueves, 8 de enero de 2009
RETOS BIOQUIMICOS EN EL AÑO 2009
El reto es comprobar que los genes tienen una mutabilidad muy variable de unos a otros la cadena secuencial de bases puede modificarse por variación en la situación o en el cambio de una o varias de las bases (mutación); hay que conocer que genes son mutados con mas frecuencia y cuales no y mapear las secuencias resistentes al fenotipo y las que son fácilmente mutadas; ya conocemos secuencias que son solidas al cambio de bases ( homeobox), y otras que la posibilidad de variar el lugar o la sustitución de una o varias bases formadas en el metabolismo de ellas ,es muy grande.
La mutación siempre tiene como causa una señal o producto de entrada (fenotipo), que de una manera directa o indirecta a traves de los metabolismos especificos de cada celula, produciendo metabolitos que van a integrarse formando parte del complejo bioquimico de transmutación del ADN y a su traves cambiar la situación o el tipo de bases, al igual que los complejos de transcripcion del ADN se encargan de la colocacion de aminoácido en la cadena secuencial de las proteinas
Si partimos que son 46 los cromosomas de la especie humana,que se reparten los 30000 genes conocidos, que el conjunto de estos pueden tener varios millones de bases y que estas son 4 , el calculo de posibilidades combinatorias son astronomicas, pero parece ser que hay cadenas de bases que no pueden cambiar sus secuenciascon lo cual se reducen mucho las posibilidades de uniones. Resulta mas arduo conocer el gran numero de señales-productos de entrada ( expresiones fenotipicas) que pueden dar origen al proceso de mutación genica.
Vemos que el fenotipo tiene una importancia cada vez mayor, que el genotipo, en la formación bioquímica y evolutiva de los seres vivos. No cabe duda que estamos en el camino de entender el proceso de la evolucion de las especies en sus mas complejos pormenores.
El reto es comprobar que los genes tienen una mutabilidad muy variable de unos a otros la cadena secuencial de bases puede modificarse por variación en la situación o en el cambio de una o varias de las bases (mutación); hay que conocer que genes son mutados con mas frecuencia y cuales no y mapear las secuencias resistentes al fenotipo y las que son fácilmente mutadas; ya conocemos secuencias que son solidas al cambio de bases ( homeobox), y otras que la posibilidad de variar el lugar o la sustitución de una o varias bases formadas en el metabolismo de ellas ,es muy grande.
La mutación siempre tiene como causa una señal o producto de entrada (fenotipo), que de una manera directa o indirecta a traves de los metabolismos especificos de cada celula, produciendo metabolitos que van a integrarse formando parte del complejo bioquimico de transmutación del ADN y a su traves cambiar la situación o el tipo de bases, al igual que los complejos de transcripcion del ADN se encargan de la colocacion de aminoácido en la cadena secuencial de las proteinas
Si partimos que son 46 los cromosomas de la especie humana,que se reparten los 30000 genes conocidos, que el conjunto de estos pueden tener varios millones de bases y que estas son 4 , el calculo de posibilidades combinatorias son astronomicas, pero parece ser que hay cadenas de bases que no pueden cambiar sus secuenciascon lo cual se reducen mucho las posibilidades de uniones. Resulta mas arduo conocer el gran numero de señales-productos de entrada ( expresiones fenotipicas) que pueden dar origen al proceso de mutación genica.
Vemos que el fenotipo tiene una importancia cada vez mayor, que el genotipo, en la formación bioquímica y evolutiva de los seres vivos. No cabe duda que estamos en el camino de entender el proceso de la evolucion de las especies en sus mas complejos pormenores.
miércoles, 19 de noviembre de 2008
SEÑALES (productos de entrada y salida ) PARA LOS METABOLISMOS, LAS CELULAS, LOS TEJIDOS, LOS ORGANOS Y SISTEMAS DE LOS SERES VIVOS. –REGULOMA-
1- Señales vitales : pueden ser de origen externo ( proceden del medio que rodea al ser vivo en su conjunto); o internas( proceden de los componentes o estructuras de los seres vivos).
2-De enfermedad : igualmente pueden ser de origen externo o interno y proceder de distintos niveles, metabolismos,celulas, tejidos,organos,etc..
En esta entrada hablaremos solo de las señales vitales que constituye lo que conocemos con el nombre de –reguloma -. El producto de entrada externo ( reguloma primario), produce una serie de reacciones bioquímicas en cadena (metabolismos) con un producto final en la misma , que puede actuar tambien de regulador (reguloma secundario); en la cadena pueden intervenir otros substratos actuando de reguladores en reacciones intermedias ( reguloma terciario).
Reguloma primario :1) por productos de entrada que proceden del exterior celular: hidratos de carbono; lipidos; proteinas; iones; agua; vitaminas; agentes fisicos ( temperatura, presion osmótica, etc.) ( ver entrada en este blogg).2) por productos que rodean o proceden del interior de las celulas, tejidos, organos o sistemas .
Reguloma de los metabolismos :
1—METABOLISMO DE LA GLUCOSA (ver en este blogg) : a) : el AMP, inhibe la HEXOSA-DIFOSFATO y el citrato y el 3-fosfo-glicerato la activan. b) : la glucosa-6-fosfato; el acetil-CoA y el fosfo-enol-piruvato inhiben la HEXOQUINASA. c) el ADP y el AMP activan la FOSFOFRUCTOQUINASA, y el ATP; el NADH; el citrato y los a. grasos la inhiben. d ) : la glucosa-6-fosfato y la fructosa-1-6-difosfato activan la PIRUVATO-QUINASA y el ATP, el NADH, y la alanina la inhiben.
2 –METABOLISMO AMINOACIDO INTERNO . (ver en este blogg) . a) : la tiroxina,GDP,NAD y ADP ( el estado de actividad de este depende de la concentración de NAD) activan la l-GLUTAMATO-DESHIDROGENASA; y el GTP, ATP, NADH y glucocorticoides, la inhiben. b): el ATP,CTP,AMP, la histidina, el triptofano, el carbamil-fosfato, la glucosamina-6-fosfato y otros metabolitos inhiben la GLUTAMINO-SINTETASA,
3—METABOLISMO FORMACION ACIDOS GRASOS. ( ver en este blogg) . a) : el citrato y el isocitrato activan la ACETIL-CoA-CARBOXILASA. b): el ATP activa la ACETIL-CoA-SINTETASA. c) : el palmitoil-CoA inhibe la BETA-CETO-ACIL-ACR-SINTASA.
4—METABOLISMOFORMACION 5-FOSFO-ALFA-D-RIBOSA. ( ver en este blogg). a) : la acetil-CoA y la malonil-CoA ,activan la GLUCOSA-6-FOSFATO-DESHIDROGENASA. b) : el ADP;GDP;UTP y CTP inhiben la RIBOSA-FOSFATO-PIROQUINASA. c) :el ADP;AMP;ATP;GMD;GDP y GTP inhiben la AMIDO-FOSFO-RIBOSIL-TRANSFERASA.
( continua)
1- Señales vitales : pueden ser de origen externo ( proceden del medio que rodea al ser vivo en su conjunto); o internas( proceden de los componentes o estructuras de los seres vivos).
2-De enfermedad : igualmente pueden ser de origen externo o interno y proceder de distintos niveles, metabolismos,celulas, tejidos,organos,etc..
En esta entrada hablaremos solo de las señales vitales que constituye lo que conocemos con el nombre de –reguloma -. El producto de entrada externo ( reguloma primario), produce una serie de reacciones bioquímicas en cadena (metabolismos) con un producto final en la misma , que puede actuar tambien de regulador (reguloma secundario); en la cadena pueden intervenir otros substratos actuando de reguladores en reacciones intermedias ( reguloma terciario).
Reguloma primario :1) por productos de entrada que proceden del exterior celular: hidratos de carbono; lipidos; proteinas; iones; agua; vitaminas; agentes fisicos ( temperatura, presion osmótica, etc.) ( ver entrada en este blogg).2) por productos que rodean o proceden del interior de las celulas, tejidos, organos o sistemas .
Reguloma de los metabolismos :
1—METABOLISMO DE LA GLUCOSA (ver en este blogg) : a) : el AMP, inhibe la HEXOSA-DIFOSFATO y el citrato y el 3-fosfo-glicerato la activan. b) : la glucosa-6-fosfato; el acetil-CoA y el fosfo-enol-piruvato inhiben la HEXOQUINASA. c) el ADP y el AMP activan la FOSFOFRUCTOQUINASA, y el ATP; el NADH; el citrato y los a. grasos la inhiben. d ) : la glucosa-6-fosfato y la fructosa-1-6-difosfato activan la PIRUVATO-QUINASA y el ATP, el NADH, y la alanina la inhiben.
2 –METABOLISMO AMINOACIDO INTERNO . (ver en este blogg) . a) : la tiroxina,GDP,NAD y ADP ( el estado de actividad de este depende de la concentración de NAD) activan la l-GLUTAMATO-DESHIDROGENASA; y el GTP, ATP, NADH y glucocorticoides, la inhiben. b): el ATP,CTP,AMP, la histidina, el triptofano, el carbamil-fosfato, la glucosamina-6-fosfato y otros metabolitos inhiben la GLUTAMINO-SINTETASA,
3—METABOLISMO FORMACION ACIDOS GRASOS. ( ver en este blogg) . a) : el citrato y el isocitrato activan la ACETIL-CoA-CARBOXILASA. b): el ATP activa la ACETIL-CoA-SINTETASA. c) : el palmitoil-CoA inhibe la BETA-CETO-ACIL-ACR-SINTASA.
4—METABOLISMOFORMACION 5-FOSFO-ALFA-D-RIBOSA. ( ver en este blogg). a) : la acetil-CoA y la malonil-CoA ,activan la GLUCOSA-6-FOSFATO-DESHIDROGENASA. b) : el ADP;GDP;UTP y CTP inhiben la RIBOSA-FOSFATO-PIROQUINASA. c) :el ADP;AMP;ATP;GMD;GDP y GTP inhiben la AMIDO-FOSFO-RIBOSIL-TRANSFERASA.
( continua)
(continuacion)
5- METABOLISMO FORMACION BASES OXIDADAS.- : a) el ATP estimula la producion de a. GUANILICO y el GTP la de a. ADENILICO. b) la síntesis de GMP es estimulada por el AMP , el cual inhibe su propia síntesis y la conversión del a. INOSINICO en ADENIL-SUCCINICO. c) el GMP inhibe su síntesis y la transformación del a. INOSINICO en a. XANTILICO.
6—METABOLISMO FORMACION RNA.- : a) el RNA-ribosomal ( subunidad 30),inhibe su síntesis por retroinhibicion al unirse al RNA-ANTISENTIDO. b) el RNA-MENSAJERO inhibe su síntesis por retroinhibicion a partir del RNA- SOLUBLE. c) el K+ y las proteinas que eliminan intrones y unen exones, activan el RNA-SOLUBLE para formar RNA-TRANSFER (TRNA) y RNA-RIBOSOMAL. d) los ribointerruptores pueden estar constituidos por metabolitos ( substratos finales) especificos y actuar como inhibidores de la síntesis del RNA-SOLUBLE . e) el RNA-ANTISENTIDO ( nacido de una de las cadenas de la doble helice del ADN actua de inhibidor del ARN-SOLUBLE, específicamente no permite que se formen ciclinas ( proteinas de division). f) los intrones regulan la formación del ARN-MENSAJERO , al intervenir en la expresión del ADN. Hay genes especificos que producen un tipo de MICRO-ARN ( se conocen mas de 250 genes que los forman) no producen proteinas pero interfieren en el metabolismo del ARN-SOLUBLE. Los metabolitos finales de las cadenas metabolicas son los “ cirujanos” que intervienen en el corte de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. Los metabolitos (generalmente proteinas ) y las hormonas actuan como activadores de la rotura enzimatica de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. La estructura tridimensional del ARN-TRANSFER es lo que da la especificidad de union al aminoácido. La bomba Na+-K+ actua en la regulación de la síntesis de ARN-SOLUBLE ( es preciso una gran concentración del K+). El viejo axioma “ un gen una proteina” a dejado de tener vigencia, se pueden producir multiples proteinas a partir de un solo gen. El ARN puede formar ADN a traves de la proteina transcriptasa-inversa y asi modificar el genoma .
7—METABOLISMO FORMACION PROTEINAS.- a) : Las proteinas al intervenir en el corte de intrones y exones actuan de inhidores o activadores de su propia formación por el ARN-MENSAJERO y del ARN-SOLUBLE al intervenir en el complejo transcripcional desde el ADN ( al menos hasta 25 proteinas pueden actuar en el operon como elementos reguladores de la expresión del genoma). Es tan importante la accion reguladora de las proteinas por su accion estructural y enzimatica sobre todos los metabolismos que podemos decir que “ somos nuestras proteinas”. Su estudio especifico requiere un blogg , no solo por su importancia ,sino por su extensión.
( continua)
5- METABOLISMO FORMACION BASES OXIDADAS.- : a) el ATP estimula la producion de a. GUANILICO y el GTP la de a. ADENILICO. b) la síntesis de GMP es estimulada por el AMP , el cual inhibe su propia síntesis y la conversión del a. INOSINICO en ADENIL-SUCCINICO. c) el GMP inhibe su síntesis y la transformación del a. INOSINICO en a. XANTILICO.
6—METABOLISMO FORMACION RNA.- : a) el RNA-ribosomal ( subunidad 30),inhibe su síntesis por retroinhibicion al unirse al RNA-ANTISENTIDO. b) el RNA-MENSAJERO inhibe su síntesis por retroinhibicion a partir del RNA- SOLUBLE. c) el K+ y las proteinas que eliminan intrones y unen exones, activan el RNA-SOLUBLE para formar RNA-TRANSFER (TRNA) y RNA-RIBOSOMAL. d) los ribointerruptores pueden estar constituidos por metabolitos ( substratos finales) especificos y actuar como inhibidores de la síntesis del RNA-SOLUBLE . e) el RNA-ANTISENTIDO ( nacido de una de las cadenas de la doble helice del ADN actua de inhibidor del ARN-SOLUBLE, específicamente no permite que se formen ciclinas ( proteinas de division). f) los intrones regulan la formación del ARN-MENSAJERO , al intervenir en la expresión del ADN. Hay genes especificos que producen un tipo de MICRO-ARN ( se conocen mas de 250 genes que los forman) no producen proteinas pero interfieren en el metabolismo del ARN-SOLUBLE. Los metabolitos finales de las cadenas metabolicas son los “ cirujanos” que intervienen en el corte de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. Los metabolitos (generalmente proteinas ) y las hormonas actuan como activadores de la rotura enzimatica de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. La estructura tridimensional del ARN-TRANSFER es lo que da la especificidad de union al aminoácido. La bomba Na+-K+ actua en la regulación de la síntesis de ARN-SOLUBLE ( es preciso una gran concentración del K+). El viejo axioma “ un gen una proteina” a dejado de tener vigencia, se pueden producir multiples proteinas a partir de un solo gen. El ARN puede formar ADN a traves de la proteina transcriptasa-inversa y asi modificar el genoma .
7—METABOLISMO FORMACION PROTEINAS.- a) : Las proteinas al intervenir en el corte de intrones y exones actuan de inhidores o activadores de su propia formación por el ARN-MENSAJERO y del ARN-SOLUBLE al intervenir en el complejo transcripcional desde el ADN ( al menos hasta 25 proteinas pueden actuar en el operon como elementos reguladores de la expresión del genoma). Es tan importante la accion reguladora de las proteinas por su accion estructural y enzimatica sobre todos los metabolismos que podemos decir que “ somos nuestras proteinas”. Su estudio especifico requiere un blogg , no solo por su importancia ,sino por su extensión.
( continua)
martes, 18 de noviembre de 2008
( continuacion)
Las proteinas son las señales internas mas importantes de la celula; se regulan entre ellas y se encuentran en intima relacion con las bombas ionicas /sodio,potasio,calcio,fosfato,etc.. Las proteinas estan en constante movimiento, plegandose y desplegandose sobre su centro activo. Las proteinas en su funcionamiento metabolico pueden actuar de inductoras (Kards) o represoras (Myc), a traves de fosforilizaciones sobre restos de tirosina o serina preferentemente, y mutilando, acetilando, fosforilando o hidroxilando , histonas nucleares.
8—METABOLISMO FORMACION BASES REDUCIDAS. (ver en este blogg) . Este metabolismo junto con el de bases oxidadas son importantes como reguladores de los metabolismos de RNA y ADN, activando o inhibiendo según la cantidad y tipo de bases formadas en ellos, asi como de la formación de nucleotidos .
La formación de desoxi-CDP o desox-CTP a partir del UMP, y la del desoxi-UMP y desoxi-UDP a partir del UDP es estimulada por el ATP. La formación del desoxi-ADP y desoxi-ATP a partir del ADP, y del desoxi-GDP y desoxi-GTP a partir del GDP es estimulada por el desoxi-GTP y el desoxi-TTP. El desoxi-ATP actua como inhibidor de la formación de todos los otros desoxi-ribonucleotidos.
9—METABOLISMO FORMACION ADN. (ver en este blogg). : Este metabolismo junto con el de ARN y el de proteinas, al tiempo que se autorregulan se relacionan uno con otro, activandose o reprimiendose a distintos niveles de sus cadenas metabolicas. Las metilaciones de las histonas que envuelven el ADN, inhiben su expresión, y las acetilaciones de las colas histonicas, activan su transcripcion. El REPLICON es un conjunto de genes cuyas proteinas ( polimerasas, metilasas, acetilasas, fosforilasas,etc. ), activan o inhiben a otros genes ( ADAPTON ), productores de ARN , dando como resultado la formación de nuevo ADN ( division celular). El AMP-ciclico junto a la proteina CAP, inhiben al replicon, igualmente lo hace un Ph alto. Los metabolitos finales de cada cadena metabolica pueden actuar de activadores o represores en la transcripción del ADN. Los genes actuan en serie o cadena formando sistemas, asi la mitosis es el juego de varios replicones sucesivamente. Cada gen tiene su replicon que se encarga de formar ADN. Hemos de tener en cuenta que el ADN es una molécula con poder de autoduplicarse ( molécula autoreplicativa ). El Ph bajo, el desoxi-TTP, y una gran concentración de nucleotidos en el medio, activan el replicon. Las bombas de iones ( sodio,potasio, calcio, magnesio, etc) , son igualmente reguladoras de los replicones. Hay un conjunto de genes que constituyen un replicon de replicones ( genes de virus aviar Mc-29 y Myc) y un adapton de adaptones que excitan la producion de ARN (genes suc del virus de Rous y Al-1 del virus de Alebron), asi como un replicon de adaptones ( gen del virus Harley y Kunster,virus de Rash y Raski).Cada gen posee un complejo transcripcional especifico que como una computadora proteica en los sitios reguladores (promotores) se activa o inhibe para procederse a la transcripcion o no del gen ; el complejo transcripcional es especifico para cada gen . Cada celula, tejido, organo tiene capacidad para producir substancias quimicas que se unen al complejo transcripcional y le hacen funcional. La transcripcion puede estar inhibida por un represor ( constituido de una a veinticinco proteinas) que se encuentra situado en el operon y una señal externa o metabolica al unirse a el con la ayuda de otras proteinas reguladoras da lugar a la expresión lineal del ADN y tridimensional de accion a la anterior.
( continua)
Las proteinas son las señales internas mas importantes de la celula; se regulan entre ellas y se encuentran en intima relacion con las bombas ionicas /sodio,potasio,calcio,fosfato,etc.. Las proteinas estan en constante movimiento, plegandose y desplegandose sobre su centro activo. Las proteinas en su funcionamiento metabolico pueden actuar de inductoras (Kards) o represoras (Myc), a traves de fosforilizaciones sobre restos de tirosina o serina preferentemente, y mutilando, acetilando, fosforilando o hidroxilando , histonas nucleares.
8—METABOLISMO FORMACION BASES REDUCIDAS. (ver en este blogg) . Este metabolismo junto con el de bases oxidadas son importantes como reguladores de los metabolismos de RNA y ADN, activando o inhibiendo según la cantidad y tipo de bases formadas en ellos, asi como de la formación de nucleotidos .
La formación de desoxi-CDP o desox-CTP a partir del UMP, y la del desoxi-UMP y desoxi-UDP a partir del UDP es estimulada por el ATP. La formación del desoxi-ADP y desoxi-ATP a partir del ADP, y del desoxi-GDP y desoxi-GTP a partir del GDP es estimulada por el desoxi-GTP y el desoxi-TTP. El desoxi-ATP actua como inhibidor de la formación de todos los otros desoxi-ribonucleotidos.
9—METABOLISMO FORMACION ADN. (ver en este blogg). : Este metabolismo junto con el de ARN y el de proteinas, al tiempo que se autorregulan se relacionan uno con otro, activandose o reprimiendose a distintos niveles de sus cadenas metabolicas. Las metilaciones de las histonas que envuelven el ADN, inhiben su expresión, y las acetilaciones de las colas histonicas, activan su transcripcion. El REPLICON es un conjunto de genes cuyas proteinas ( polimerasas, metilasas, acetilasas, fosforilasas,etc. ), activan o inhiben a otros genes ( ADAPTON ), productores de ARN , dando como resultado la formación de nuevo ADN ( division celular). El AMP-ciclico junto a la proteina CAP, inhiben al replicon, igualmente lo hace un Ph alto. Los metabolitos finales de cada cadena metabolica pueden actuar de activadores o represores en la transcripción del ADN. Los genes actuan en serie o cadena formando sistemas, asi la mitosis es el juego de varios replicones sucesivamente. Cada gen tiene su replicon que se encarga de formar ADN. Hemos de tener en cuenta que el ADN es una molécula con poder de autoduplicarse ( molécula autoreplicativa ). El Ph bajo, el desoxi-TTP, y una gran concentración de nucleotidos en el medio, activan el replicon. Las bombas de iones ( sodio,potasio, calcio, magnesio, etc) , son igualmente reguladoras de los replicones. Hay un conjunto de genes que constituyen un replicon de replicones ( genes de virus aviar Mc-29 y Myc) y un adapton de adaptones que excitan la producion de ARN (genes suc del virus de Rous y Al-1 del virus de Alebron), asi como un replicon de adaptones ( gen del virus Harley y Kunster,virus de Rash y Raski).Cada gen posee un complejo transcripcional especifico que como una computadora proteica en los sitios reguladores (promotores) se activa o inhibe para procederse a la transcripcion o no del gen ; el complejo transcripcional es especifico para cada gen . Cada celula, tejido, organo tiene capacidad para producir substancias quimicas que se unen al complejo transcripcional y le hacen funcional. La transcripcion puede estar inhibida por un represor ( constituido de una a veinticinco proteinas) que se encuentra situado en el operon y una señal externa o metabolica al unirse a el con la ayuda de otras proteinas reguladoras da lugar a la expresión lineal del ADN y tridimensional de accion a la anterior.
( continua)
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