miércoles, 19 de noviembre de 2008

SEÑALES (productos de entrada y salida ) PARA LOS METABOLISMOS, LAS CELULAS, LOS TEJIDOS, LOS ORGANOS Y SISTEMAS DE LOS SERES VIVOS. –REGULOMA-

1- Señales vitales : pueden ser de origen externo ( proceden del medio que rodea al ser vivo en su conjunto); o internas( proceden de los componentes o estructuras de los seres vivos).
2-De enfermedad : igualmente pueden ser de origen externo o interno y proceder de distintos niveles, metabolismos,celulas, tejidos,organos,etc..
En esta entrada hablaremos solo de las señales vitales que constituye lo que conocemos con el nombre de –reguloma -. El producto de entrada externo ( reguloma primario), produce una serie de reacciones bioquímicas en cadena (metabolismos) con un producto final en la misma , que puede actuar tambien de regulador (reguloma secundario); en la cadena pueden intervenir otros substratos actuando de reguladores en reacciones intermedias ( reguloma terciario).
Reguloma primario :1) por productos de entrada que proceden del exterior celular: hidratos de carbono; lipidos; proteinas; iones; agua; vitaminas; agentes fisicos ( temperatura, presion osmótica, etc.) ( ver entrada en este blogg).2) por productos que rodean o proceden del interior de las celulas, tejidos, organos o sistemas .
Reguloma de los metabolismos :
1—METABOLISMO DE LA GLUCOSA (ver en este blogg) : a) : el AMP, inhibe la HEXOSA-DIFOSFATO y el citrato y el 3-fosfo-glicerato la activan. b) : la glucosa-6-fosfato; el acetil-CoA y el fosfo-enol-piruvato inhiben la HEXOQUINASA. c) el ADP y el AMP activan la FOSFOFRUCTOQUINASA, y el ATP; el NADH; el citrato y los a. grasos la inhiben. d ) : la glucosa-6-fosfato y la fructosa-1-6-difosfato activan la PIRUVATO-QUINASA y el ATP, el NADH, y la alanina la inhiben.
2 –METABOLISMO AMINOACIDO INTERNO . (ver en este blogg) . a) : la tiroxina,GDP,NAD y ADP ( el estado de actividad de este depende de la concentración de NAD) activan la l-GLUTAMATO-DESHIDROGENASA; y el GTP, ATP, NADH y glucocorticoides, la inhiben. b): el ATP,CTP,AMP, la histidina, el triptofano, el carbamil-fosfato, la glucosamina-6-fosfato y otros metabolitos inhiben la GLUTAMINO-SINTETASA,
3—METABOLISMO FORMACION ACIDOS GRASOS. ( ver en este blogg) . a) : el citrato y el isocitrato activan la ACETIL-CoA-CARBOXILASA. b): el ATP activa la ACETIL-CoA-SINTETASA. c) : el palmitoil-CoA inhibe la BETA-CETO-ACIL-ACR-SINTASA.
4—METABOLISMOFORMACION 5-FOSFO-ALFA-D-RIBOSA. ( ver en este blogg). a) : la acetil-CoA y la malonil-CoA ,activan la GLUCOSA-6-FOSFATO-DESHIDROGENASA. b) : el ADP;GDP;UTP y CTP inhiben la RIBOSA-FOSFATO-PIROQUINASA. c) :el ADP;AMP;ATP;GMD;GDP y GTP inhiben la AMIDO-FOSFO-RIBOSIL-TRANSFERASA.
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5- METABOLISMO FORMACION BASES OXIDADAS.- : a) el ATP estimula la producion de a. GUANILICO y el GTP la de a. ADENILICO. b) la síntesis de GMP es estimulada por el AMP , el cual inhibe su propia síntesis y la conversión del a. INOSINICO en ADENIL-SUCCINICO. c) el GMP inhibe su síntesis y la transformación del a. INOSINICO en a. XANTILICO.
6—METABOLISMO FORMACION RNA.- : a) el RNA-ribosomal ( subunidad 30),inhibe su síntesis por retroinhibicion al unirse al RNA-ANTISENTIDO. b) el RNA-MENSAJERO inhibe su síntesis por retroinhibicion a partir del RNA- SOLUBLE. c) el K+ y las proteinas que eliminan intrones y unen exones, activan el RNA-SOLUBLE para formar RNA-TRANSFER (TRNA) y RNA-RIBOSOMAL. d) los ribointerruptores pueden estar constituidos por metabolitos ( substratos finales) especificos y actuar como inhibidores de la síntesis del RNA-SOLUBLE . e) el RNA-ANTISENTIDO ( nacido de una de las cadenas de la doble helice del ADN actua de inhibidor del ARN-SOLUBLE, específicamente no permite que se formen ciclinas ( proteinas de division). f) los intrones regulan la formación del ARN-MENSAJERO , al intervenir en la expresión del ADN. Hay genes especificos que producen un tipo de MICRO-ARN ( se conocen mas de 250 genes que los forman) no producen proteinas pero interfieren en el metabolismo del ARN-SOLUBLE. Los metabolitos finales de las cadenas metabolicas son los “ cirujanos” que intervienen en el corte de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. Los metabolitos (generalmente proteinas ) y las hormonas actuan como activadores de la rotura enzimatica de intrones y exones para formar RNA-MENSAJERO. La estructura tridimensional del ARN-TRANSFER es lo que da la especificidad de union al aminoácido. La bomba Na+-K+ actua en la regulación de la síntesis de ARN-SOLUBLE ( es preciso una gran concentración del K+). El viejo axioma “ un gen una proteina” a dejado de tener vigencia, se pueden producir multiples proteinas a partir de un solo gen. El ARN puede formar ADN a traves de la proteina transcriptasa-inversa y asi modificar el genoma .
7—METABOLISMO FORMACION PROTEINAS.- a) : Las proteinas al intervenir en el corte de intrones y exones actuan de inhidores o activadores de su propia formación por el ARN-MENSAJERO y del ARN-SOLUBLE al intervenir en el complejo transcripcional desde el ADN ( al menos hasta 25 proteinas pueden actuar en el operon como elementos reguladores de la expresión del genoma). Es tan importante la accion reguladora de las proteinas por su accion estructural y enzimatica sobre todos los metabolismos que podemos decir que “ somos nuestras proteinas”. Su estudio especifico requiere un blogg , no solo por su importancia ,sino por su extensión.
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martes, 18 de noviembre de 2008

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Las proteinas son las señales internas mas importantes de la celula; se regulan entre ellas y se encuentran en intima relacion con las bombas ionicas /sodio,potasio,calcio,fosfato,etc.. Las proteinas estan en constante movimiento, plegandose y desplegandose sobre su centro activo. Las proteinas en su funcionamiento metabolico pueden actuar de inductoras (Kards) o represoras (Myc), a traves de fosforilizaciones sobre restos de tirosina o serina preferentemente, y mutilando, acetilando, fosforilando o hidroxilando , histonas nucleares.
8—METABOLISMO FORMACION BASES REDUCIDAS. (ver en este blogg) . Este metabolismo junto con el de bases oxidadas son importantes como reguladores de los metabolismos de RNA y ADN, activando o inhibiendo según la cantidad y tipo de bases formadas en ellos, asi como de la formación de nucleotidos .
La formación de desoxi-CDP o desox-CTP a partir del UMP, y la del desoxi-UMP y desoxi-UDP a partir del UDP es estimulada por el ATP. La formación del desoxi-ADP y desoxi-ATP a partir del ADP, y del desoxi-GDP y desoxi-GTP a partir del GDP es estimulada por el desoxi-GTP y el desoxi-TTP. El desoxi-ATP actua como inhibidor de la formación de todos los otros desoxi-ribonucleotidos.
9—METABOLISMO FORMACION ADN. (ver en este blogg). : Este metabolismo junto con el de ARN y el de proteinas, al tiempo que se autorregulan se relacionan uno con otro, activandose o reprimiendose a distintos niveles de sus cadenas metabolicas. Las metilaciones de las histonas que envuelven el ADN, inhiben su expresión, y las acetilaciones de las colas histonicas, activan su transcripcion. El REPLICON es un conjunto de genes cuyas proteinas ( polimerasas, metilasas, acetilasas, fosforilasas,etc. ), activan o inhiben a otros genes ( ADAPTON ), productores de ARN , dando como resultado la formación de nuevo ADN ( division celular). El AMP-ciclico junto a la proteina CAP, inhiben al replicon, igualmente lo hace un Ph alto. Los metabolitos finales de cada cadena metabolica pueden actuar de activadores o represores en la transcripción del ADN. Los genes actuan en serie o cadena formando sistemas, asi la mitosis es el juego de varios replicones sucesivamente. Cada gen tiene su replicon que se encarga de formar ADN. Hemos de tener en cuenta que el ADN es una molécula con poder de autoduplicarse ( molécula autoreplicativa ). El Ph bajo, el desoxi-TTP, y una gran concentración de nucleotidos en el medio, activan el replicon. Las bombas de iones ( sodio,potasio, calcio, magnesio, etc) , son igualmente reguladoras de los replicones. Hay un conjunto de genes que constituyen un replicon de replicones ( genes de virus aviar Mc-29 y Myc) y un adapton de adaptones que excitan la producion de ARN (genes suc del virus de Rous y Al-1 del virus de Alebron), asi como un replicon de adaptones ( gen del virus Harley y Kunster,virus de Rash y Raski).Cada gen posee un complejo transcripcional especifico que como una computadora proteica en los sitios reguladores (promotores) se activa o inhibe para procederse a la transcripcion o no del gen ; el complejo transcripcional es especifico para cada gen . Cada celula, tejido, organo tiene capacidad para producir substancias quimicas que se unen al complejo transcripcional y le hacen funcional. La transcripcion puede estar inhibida por un represor ( constituido de una a veinticinco proteinas) que se encuentra situado en el operon y una señal externa o metabolica al unirse a el con la ayuda de otras proteinas reguladoras da lugar a la expresión lineal del ADN y tridimensional de accion a la anterior.
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Las substancias hormonales, intervienen en la transcripcion tridimensional del nucleosoma, permitiendo al acceso de la transcripcion lineal en el ADN-nuclear, podemos hablar de una regulación primaria y otra secundaria de la cadena de ADN.
La regulación del metabolismo del ADN , tiene una dimension de estudio tan grande, que requiere un blogg expresamente para ello, sobre todo por que interviene de un modo muy especifico en el ciclo celular, junto a multiples proteinas y RNA formadas previamente por los respectivos metabolismos, de la MITOSIS-DUPLICACION celular.
10—11—12-. METABOLISMOS DE FORMACION DE GLUCO-LIPIDOS-FOSFO-LIPIDOS-GLUCO-PROTEINAS-MUCOPROTEINAS-LIPOPROTEINAS –COLESTEROL Y HORMONAS ESTEROIDES.- ( ver en este blogg)-: Todos estos metabolismos dan lugar a la formacion de productos finales que como el colesterol y algunos fosfolipidos van a constituir estructuras de membranas celulares ( receptores) unas veces y otras gluco-lipidos, gluco-proteinas, lipo-proteinas, muco-proteinas (glucocalix) van a formar un medio que rodea a la celula constituyendo multiples señales de regulación ; como ejemplos tenemos : la fibronectina una glicoproteina interviene en la adhesividad intercelular; las lipoproteínas tienen estructura y complementaridad con el plasminogeno de la sangre e intervienen en los procesos de cicatrizacion y division celulares ( factores de crecimiento) ; los esfingolipidos de membrana se modifican significamente durante la diferenciación y division celulares .etc. Estos metabolismos forman infinidad de señales para la formación de tejidos,organos y sistemas.
La formación de las glicoproteinas ( oligosacaridos: lactosa,galactosa,manosa,mucosa etc. unidos a mucinas: glucosamina,acetil-galactosamina, a, acetil-neuraminico. etc ) son formadas a traves de las enzimas glucotransferasas constituyendose un codigo glucidico que va a dar por union de ellos en un orden determinado las colas que emergiendo de la membrana forman lo que se conoce con el nombre de reconocimiento celular de membranas dando con ello una especificidad funcional de celula,tejido.organo o sistema.
En la via del lanasterol hay un punto clave regulado por el NADPH y el FAD, que pude desviar la cadena hacia la ruta de la diferenciación o de la division celulares.
13—METABOLISMO OXIDATIVO DEL ACETIL-CoA ( CICLO DE KREBS).( ver en este blogg).–a) : la PIRUVATO –CARBOXILASA se activa por el acetil-CoA. b) la PIRUVATO DESHIDROGENASA es activada por el Ca++ y ASP e inhibida por el ATP. c) la SUCCINATO-DESHIDROGENASA es activada por el succinato, el fosfato, el ATP, y la Co-Q reducida, y la inhibe el oxalacetato. d) la ISOCITRATO-DESHIDROGENASA la activa el ADP y la inhibe el ATP y el NADH.
14—METABOLISMO FORMACION DE UREA ( ver en este blogg). a) la CARBAMIL-FOSFATO-SINTASA ( amoniaco), se activa por acetil-glutamato. Las POLIAMINAS como productos finales de la cadena metabolica actuan como reguladores en la transcripcion en los metabolismos del RNA y ADN influyendo en la diferenciación o division celulares.
El OXIDO NITROSO, activa el GMP-ciclico( guanilato-ciclina ), saca K+ y Ca++ y mete PO— en la celula; aumenta el Ph celular¸inhibe la accion de los glucocorticoides y produce vasodilatacion.
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15-16-17-18-. Estos METABOLISMOS ( ver en este blogg), las regulaciones son multiples pues se autorregulan por metabolitos finales. Las mitocondrias son organizaciones basicas en la regulación de los otros metabolismos a traves de los nucleotidos ATP y NAD –NAH que en ellas se forman,asi como la de H2O. La eliminación de H cambia el Ph necesario para que se lleven a cabo muchas de la reacciones metabolicas . En las mitocondrias la reaccion del NADPH+NAD pasa a NADP+NADH, la velocidad de reaccion sel NADPH hacia el NAD es mayor que a la inversa, pero en presencia de un exceso de ATP se forma NADPH a partir del NAD; el NAD + ATP pasa a NADP y ADP y a la inversa ; el NAD reacciona con el FP1 (flavoproteina) ; sobre el NAD actuan el FP4 –oxoglutarato, el FP5-piruvato, y los substratos : malato, isocitrato,glutamato e hidroxil-acil-CoA; sobre el centro de la coenzima –Q interactuan el FP2 –succinato el FP3-acil-graso-CoA y el FP4 –glicerofosfato.
Los fosfo-lipidos de membrana tienen una gran importancia en la transmisión de señales en la celula , asi los receptores ( proteinas –G ) activadas por el GTP, estimulan una enzima amplificadora en la cara interna de la membrana, dando lugar a segundos mensajeros ; la ADENILATO-CICLASA convierte el ATP en AMP-ciclico. y una fosfolipasa corta el fosfolipido de membrana 4,5-difosfato-fosfatidil-inositol ( PIP2) en diacil-glicerol (DG) y inositol-trifosfato(IP3),( la acetil-cortisona tambien puede hacer la hidrólisis ) ;la hidrólisis por la GTP-asa, cataliza la el paso del GTP a GDP y cierra el poro de del receptor de membrana para la señal; parece ser que la activacion de la adenilato-ciclasa y formarse AMP-ciclico se produce una inhibición de la misma por el GTP del interior de la membrana de la proteinaG . El AMP-ciclico activa una Kinasa-A que actua sobre lipasas y otras enzimas que intervienen como inhibidoras de la transcripcion en el metabolismo del ADN, y de la apertura de los poros de las bombas ionicas ( preferentemente del calcio y el sodio ). La entrada de calcio en la neurona induce la liberación de neurotansmisores y la bomba Na+-K+ con la del Ca++. Las membranas celulares poseen tres tipos de lipidos de inositol y solo el fosfatidil-inositol se puede convertir en PIP2 este se hidroliza en respuesta a una señal y forma diacil-glicerol y IP3. la enzima que interviene es la lipasa-C, y se necesita GTP en la activacion , los dos productos se pueden reciclar por medio de una inositol-1-fosfatasa (se inhibe por el litio) y se vuelve a formar el fosfatidil-inositol.La administración de serotonina induce la formación de IP3 y este produce la liberación de Ca++ encerrado en el reticulo-endoplasmico de las celulas (membrana interna que forma un sistema inerno celular ). El Ca ++ dispara la contracion muscular al unirse a la proteina troponina C del musculoprovocando un cambio conformacional que insta a la contracion del músculo.
El otro producto de la hidrólisis del lipido de inositol( PIP2) es el diacil-glicerol, que permanece en la membrana y activa una protein-quinasa ( quinasa-C ) ,que activa las bombas de iones . Vemos que hay dos ramas de respuesta a la señalización ,una la del IP3 a traves del Ca++ y la del diacil-glicerol a traves de la quinasa-C y bombas de iones,esta via parece tener mucha influencia en la producion de secreciones por la celula y las dos juntas pueden incidir en la síntesis de ADN y regular el crecimiento; por otro lado tenemos la ruta del AMP-ciclico, que al intervenir en la transcripcion del ADN, puede producir o inhibir la formación de proteinasque constituyen lo que conocemos como factores de crecimiento (insulina .factor de crecimiento epidermico-EGF) que actuando sobre receptores especificos activan la ruta de las tiro-quinasas, y otros factores de crecimiento derivados de las plaquetas (PDFG).las hormonas, y los neurotransmisores actuarian por las vias del IP3 y diacil-glicerol.
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Otro mensajero que parece estar relacionado a los mecanismos del IP3 y diacil-glicerol, es el GMP-ciclico, formado por la guanilato-ciclasa y que puede seguir la ruta de regulación de bombas de iones, modula la accion del Ca++ ( como el AMP-ciclico) y produce la abertura de los canales de Na+. Las bombas ionicas de Ca++ y Na+ , son antagonicas ( se regulan mutuamente). Ejemplo de regulación ionica es la que conduce a los fotones a producir la sensación de vision, al incidir sobre una proteina de la retina (rodopsina) que los absorbe e induce a una molécula llamada transduccina (miembro de la familia de proteinas-G) a unirse a GTP y activar el enzima fosfodiesterasa con disminución del GMP-ciclico y con ello la inhibición (cierre) de los canales en la bomba de Na+.
En el REGULOMA son reacciones bioquímicas importantes las que se dan en los metabolismos de formación de bases oxidadas y reducidas (verlas en este blogg), y que a su traves se van a producir los nucleosidos de alta energia tipo ADP-ATP,GDP-GTP, CDP-CTP, TDP-TTP,NAD-NADH ,etc. regulando no solo las adenilato-ciclasa, guanilato-ciclasa,fosfodiesterasa, fosfatasas, sino interviniendo en la gran mayoria de las regulaciones del metabolismo general.
La mayoria de las proteinas que intervienen como activadoras o inhibidoras en el complejo de transcripcion del ADN ( operon) a RNA-PROTEINA, son enzimas que intervienen en etapas o procesos metabolicos basicos que no pueden ser regulados por substratos finales de la cadena metabolica.
La diferenciación y la division celulares como etapas importantes del complejo metabolico, dependen de un juego de regulaciones que tienen su origen en señales vitales externas e internas que por su gran variabilidad y su complejidad , todavía no hemos llegado a ordenar del todo para un conocimiento acabado de la bioquímica de los seres vivos.